В целях оптимизации работы Департамент финансов и бухгалтерского учета объединен с Департаментом реализации инвестиционных программ и проектов. Новое подразделение будет называться Департамент финансов, его возглавит Владимир Мешков, ранее руководивший Департаментом реализации инвестиционных программ и проектов. Главной задачей объединенного департамента остается исполнение полномочий министерства по реализации федеральных целевых программ. Курировать работу нового подразделения будет заместитель министра Елена Сиэрра.

В соответствии с Указом Президента по передаче Минстрою России от упраздненного Минрегиона РФ полномочий по выработке и реализации государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере градостроительного зонирования создан новый Департамент градостроительного зонирования и планировки территорий. Подразделение создано на базе Департамента реализации специальных программ и проектов, его возглавит Оксана Гармаш. Курировать работу департамента будет заместитель министра Юрий Рейльян.

Кроме того, в Минстрое России создается Департамент контроля, к функциям которого отнесен аудит деятельности регионов по использованию межбюджетных трансфертов, направляемых Министерством, а также реализация непосредственного контроля за строительством объектов в рамках программ Минстроя. Новое подразделение будет создано на базе существующих отделов внутреннего финансового аудита и оперативной дежурной службы ведомства. Новый департамент находится в процессе формирования, руководитель пока не определен. Курировать работу нового подразделения будет первый заместитель министра Леонид Ставицкий.